1.一种桑树白粉病病原菌Phyllactinia mori核糖体RNA,其特征在于,所述核糖体RNA的全长cDNA序列如SEQ.ID.NO1所示。
2.根据权利要求1所述桑树白粉病病原菌Phyllactinia mori的核糖体RNA序列在定量检测桑树白粉病病原菌Phyllactinia mori的应用。
3.根据权利要求2所述的应用,其特征在于,所述应用的方法包括以下步骤:S1.收集桑树病叶;
S2.提取桑树病叶的总DNA;
S3.IlluminaDNA文库构建;
S4.Illumina高通量测序;
S5.去除测序数据中桑树基因组序列;
S6.组装微生物基因组序列;
S7.组装完整核糖体DNA序列
S8.对比分析核糖体DNA序列;
步骤S3所述Illumina DNA文库构建的方法为:依照Illumina文库构建流程,将所述步骤S2中所述总DNA构建为片段大小400~600bp的双末端高通量测序文库;
步骤S8所述对比分析核糖体DNA序列的方法为:使用序列比对分析软件,将步骤S7所述完整核糖体DNA序列与桑树白粉病病原菌Phyllactinia mori的rRNA的全长cDNA序列进行比对。
4.根据权利要求3所述的应用,其特征在于,步骤S5所述去除测序数据中桑树基因组序列的方法为:利用比对软件对步骤S4中所述高通量测序数据进行数据比对分析;选择比对算法,将所述测序数据与桑树参考基因组进行比对,并将比对上参考基因组的所述测序数据判定为桑树基因组序列;使用编写的计算机程序从所述测序数据中去除桑树基因组序列;
S5所述去除桑树的基因组序列选用的参考基因组序列为:
桑属Morusnotabilis全基因组序列GCA_000414095.2和叶绿体基因组序列NC_
027110.1;
步骤S6所述组装微生物基因组序列的方法为:使用组装软件对步骤S5所述已去除桑树基因组序列的测序数据进行组装;
步骤S7所述组装完整核糖体DNA序列的方法为:采用比对软件,对所述组装序列进行比对,根据比对结果从测序数据中获取双末端测序片段,使用组装软件对序列进行组装和延伸,经多个循环操作,直至获得完整的核糖体DNA序列。
5.根据权利要求4所述的应用,其特征在于,步骤S5所述比对软件为bwa 0.7.12-r1039软件;步骤S5所述比对算法为mem比对算法;步骤S5所述将测序数据与桑树参考基因组进行比对是双末端比对方法和bwa 0.7.12-r1039软件的默认参数;步骤S5所述编写的计算机程序优选用python计算机语言编写;步骤S6所述组装软件为MetaVelvet v1.2.01;步骤S7所述比对软件为bwa 0.7.12-r1039软件;步骤S7所述比对方法采用无错配0mismatch和无断裂0gap比对;步骤S7所述组装软件为MetaVelvet v1.2.01软件。
6.根据权利要求1所述桑树白粉病病原菌Phyllactinia mori的核糖体RNA序列在真菌种属分类方面的应用。