1.一种用于评估公猪精液品质的遗传标记,其特征在于,该遗传标记为SNP分子标记,所述遗传标记位于猪9号染色体33671231bp位置或猪1号染色体38067414bp位置。
2.根据权利要求1所述的遗传标记,其特征在于,所述遗传标记位于猪9号染色体
33671231bp位置,当所述遗传标记为G时,提示待评估公猪的精子活力高;
或所述遗传标记位于猪1号染色体38067414bp位置,当所述遗传标记为A时,提示待评估公猪的精子畸形率低。
3.一种用于评估公猪精液品质的基因序列,其特征在于,该基因序列包括权利要求1所述的遗传标记;
所述遗传标记位于猪9号染色体33671231bp位置时,所述基因序列如下所示:
5’‑GCTTAACATTTAATCTGTTCACATACATTTTTCAAATGATACCTTGGGGCGAGGAGGCAAAGGAGAAAAAAATAGCTGTATTGCTTTACAAGGCAAAGGA(SEQ ID NO:1)‑E‑GGTAACAGCAGGCTAATGCCTTAAAGACTGTGCTCCCCTTAGGAGAGATTGGGAGGTAGGTTTATAGTTTGCGGGAGTGAAAGATAGGGCTGCACATAAG‑’3(SEQ ID NO:2),其中E为所述遗传标记的突变位点;
所述遗传标记位于猪1号染色体38067414bp位置时,所述基因序列如下所示:
5’‑GCTGGCTCCTTATGGAAAGCTAGTACATTGGTGATAACATGAAATCAACTAAAAGCGCAATGATCATGCCCTCATGTTTTCTTTAAAATAAGCACCCATC(SEQ ID NO:3)‑F‑TCTTAGTTATGTCTTATGAAACATTCTGATGGGCAAAGAAAAAGTTGAGGCAAAGGGCAGGATACAGAACAGAAAATAGCAAATATCTAGATGGCTCACA‑’3(SEQ ID NO:4),其中F为所述遗传标记的突变位点。
4.一种用于评估公猪精液品质的方法,其特征在于,该方法包括获取权利要求1‑2中所述遗传标记的检测结果,根据检测结果判断公猪的精液品质。
5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,所述遗传标记位于猪9号染色体
33671231bp位置,当遗传标记为G时,则判断公猪的精子活力高。
6.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,所述遗传标记位于猪1号染色体
38067414bp位置,当遗传标记为A时,则判断公猪的精子畸形率低。
7.一种公猪的选育方法,其特征在于,按照权利要求4‑6中任一项所述的方法进行检测,根据遗传标记的基因型判断公猪的精液品质,留用精液品质高的公猪;所述遗传标记位于以下位置:猪9号染色体33671231bp位置或猪1号染色体38067414bp位置。
8.根据权利要求7所述的选育方法,其特征在于,所述遗传标记位于猪9号染色体
33671231bp位置,当遗传标记的基因型为GG时,则判断公猪的精子活力高,留用公猪;所述公猪的品种为长白猪。
9.根据权利要求7所述的选育方法,其特征在于,所述遗传标记位于猪1号染色体
38067414bp位置,当遗传标记的基因型为AA时,则判断公猪的精子畸形率低,留用公猪;所述公猪的品种为长白猪。
10.一种应用权利要求1‑2任一项所述遗传标记的筛选方法,其特征在于,包括以下步骤:采集表型数据:采集待测猪的精液性状的表型数据;
获取SNP分子标记:对所述待测猪取样,提取DNA,基因分型,得到覆盖全基因组的SNP分子标记;对所述覆盖全基因组的SNP分子标记进行物理位置更新、质量控制;
数据分析:结合所述表型数据,对质量控制后的SNP分子标记进行全基因组关联分析,并分析不同基因型群体猪的精液品质的差异情况,筛选得到用于评估公猪精液品质的SNP分子标记。