1.一种丁香假单胞菌中的重组系统,其特征在于,核苷酸序列为如SEQ ID No.37所示序列,其中所述重组系统携带庆大霉素基因、阿拉伯糖调控基因和重组酶基因amp‑araC‑red、广宿主复制子pBBR1和蔗糖敏感负筛选基因sacB。
2.一种如权利要求1所述的丁香假单胞菌中的重组系统的构建方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)将氨苄青霉素抗性基因、阿拉伯糖调控基因和重组酶基因amp‑araC‑red和广宿主r
复制子pBBR1酶切连接,得到pBBR1‑Amp‑AraC‑Red;
r
(2)将蔗糖敏感负筛选基因sacB连接至线性化质粒pBBR1‑Amp ‑AraC‑Red上,得到r
pRed01‑Amp;
r
(3)将pRed01‑Amp的氨苄青霉素抗性基因替换成庆大霉素基因,得到所述丁香假单胞r
菌中的重组系统pRed02‑Gm。
3.如权利要求1所述的丁香假单胞菌中的重组系统在丁香假单胞菌基因重组中的应用,其特征在于,
所述基因重组为基因敲除,具体为敲除Psyr_1621的全部基因或Psyr_3467的部分基因。
4.如权利要求3所述的应用,其特征在于,所述丁香假单胞菌为丁香假单胞菌丁香致病变种B728a。
5.一种对丁香假单胞菌进行基因重组的方法,其特征在于,利用权利要求1中所述重组系统对丁香假单胞菌进行基因敲除。
6.如权利要求5所述的方法,其特征在于,所述基因重组为对丁香假单胞菌进行Psyr_
1621全基因敲除,包括以下步骤:(1)权利要求1中所述重组系统通过电击转化导入丁香假单胞菌中,得到含有权利要求r
1中所述重组系统的重组子Pss B728a/pRed02‑Gm;
(2)以Pss B728a总DNA为模板,PCR扩增Psyr_1621基因的上游和下游片段;以pKD4质粒r
为模板,扩增FRT‑Kan ‑FRT片段;将PCR扩增获得的Psyr_1621基因的上游和下游片段以及r
FRT‑Kan‑FRT片段共同作为模板,通过重叠PCR方法,使Psyr_1621基因的上游片段、FRT‑r
Kan ‑FRT片段和Psyr_1621基因的下游片段搭桥成一个大片段;用Ω‑PCR的方法将所述大r
片段和pSRK‑Gm质粒反应,转化后通过筛选和测序鉴定,获得用于Psyr_1621基因敲除的敲r
除盒片段克隆载体pSRK‑1621‑Kan;
r
(3)以步骤(2)得到的pSRK‑1621‑Kan作为模板,分别PCR扩增带有500bp和250bp同源臂r
的卡那霉素抗性基因,将PCR扩增产物电击转化至步骤(1)得到的Pss B728a/pRed02‑Gm中,经过验证后得到Psyr_1621全基因敲除的丁香假单胞菌。
7.如权利要求5所述的方法,其特征在于,所述基因重组为对丁香假单胞菌进行Psyr_
3467基因的N端600bp敲除,保留330bp,同时设计不破坏阅读框的FRT cassette,包括以下步骤:
(1)权利要求1所述的Red重组系统通过电击转化导入至丁香假单胞菌中,得到含有权r
利要求1所述的Red重组系统的重组子Pss B728a/pRed02‑Gm;
(2)以Pss B728a总DNA为模板,PCR扩增Psyr_3467基因的上游和下游片段;将Psyr_
3467基因的上游和下游片段进行酶切连接至pMD19‑T载体,经转化及菌落PCR筛选,得到转r r
化子pMD19‑T‑3467‑up‑dn;以pHSG399‑FRT‑Kan‑FRT质粒为模板,PCR扩增FRT‑Kan‑FRT片r
段,再将所述FRT‑Kan‑FRT片段与所述pMD19‑T‑3467‑up‑dn酶切连接,再经转化及菌落PCRr
筛选,获得用于Psyr_3467基因敲除的敲除盒片段克隆载体pMD19‑3467‑Kan;
r
(3)以步骤(2)得到的pMD19‑3467‑Kan作为模板,PCR扩增带有750bp同源臂的卡那霉素r
抗性基因,将PCR扩增产物电击转化至步骤(1)得到的Pss B728a/pRed02‑Gm中,经过验证后得到Psyr_3467部分基因敲除的丁香假单胞菌。