欢迎来到知嘟嘟! 联系电话:13336804447 卖家免费入驻,海量在线求购! 卖家免费入驻,海量在线求购!
知嘟嘟
我要发布
联系电话:13336804447
知嘟嘟经纪人
收藏
专利号: 2020106582779
申请人: 南阳师范学院
专利类型:发明专利
专利状态:已下证
专利领域: 生物化学;啤酒;烈性酒;果汁酒;醋;微生物学;酶学;突变或遗传工程
更新日期:2024-01-05
缴费截止日期: 暂无
价格&联系人
年费信息
委托购买

摘要:

权利要求书:

1.一种预测结肠癌预后的标志物,其特征在于,所述标志物包括自噬相关的lncRNA 和/或自噬相关的mRNA 标志物,所述自噬相关的lncRNA 为CASC9、PCAT6 、AP006621.2 、GS1‑124K5.4 、MIR4435‑2HG 、AL354993.2 、AC048344.4 、AC010973.2 、AL590483.1 、AL137782.1 、STAG3L5P‑PVRIG2P‑PILRB、LINC00513、SNHG16 和AP001554.1,所述自噬相关的mRNA 为GRID1、DAPK1、RAB7A、PELP1、ULK3 和WIPI2。

2.根据权利要求1 所述的预测结肠癌预后的标志物在结肠癌预后中的应用;所述应用为构建预测结肠癌预后风险的模型、构建预测结肠癌生存率的模型、制备用于预测结肠癌预后风险的检测试剂或装置、制备用于预测结肠癌生存率的检测试剂或装置中的任意一种或几种的组合。

3.一种预测结肠癌预后风险的模型,其特征在于,所述模型包括自噬相关mRNA风险预测模型、自噬相关lncRNA 风险预测模型和/或结合所述自噬相关mRNA和自噬相关lncRNA 的风险预测模;所述自噬相关mRNA 风险预测模型公式= (0.524×expression level of UKL3)+(1.022×expression level of GRID1)+(0.254×expression level of DAPK1)+(0.410×expression level of PELP1)+(0.608×expression level of WIP2)+(1.097×expression level of RAB7A);所述自噬相关lncRNA 风险预测模型公式= (0.183×expression level of CASC9)+(0.334×expression level of PCAT6)+(0.348×expression level of AP006621.2)+(0.409×expression level of GS1‑124K5.4)+(0.651×expression level of MIR4435‑2HG)+(0.838×expression level of AL354993.2)+(0.881×expression level of AC048344.4)+(1.145×expression level of AC010973.2)+(‑0.882×expression level of AL590483.1)+(‑0.875×expression level of AL137782.1)+(‑0.688×expressionlevel of STAG3L5P‑PVRIG2P‑PILRB)+(‑

0.665×expression level of LINC00513)+(‑0.663×expression level of SNHG16)+(‑

0.573×expression level of AP001554.1);结合所述自噬相关mRNA 和自噬相关lncRNA 的风险预测模型公式=(‑0.361×expression level of AP001554.1)+(0.150×expression level of AP006621.2)+(0.023×expression level of ULK3)+(0.564×expression Level of AL354993.2)+(0.379×expression level of MIR4435‑2HG)+(‑

0.025×expression level of GRID1)+(0.130×expression level of PCAT6)+(‑0.591×expression level of STAG3L5P‑PVRIG2P‑PILRB)+(0.021×expression level of CASC9)+(‑0.169×expression level of LINC00513)+(0.015×expression level of DAPK1)+(‑0.125×expression level of SNHG16)+(0.769×expression level of AC048344.4)+(0.029×expression level of GS1‑124K5.4)+(‑0.005×expression level of PELP1)+(0.023×expression level of WIPI2)+(‑1.118×expression level of AL137782.1)+(0.814×expression level of AC010973.2)+(0.01×expression level of RAB7A)+(‑0.641×expression level of AL590483.1)。

4.一种预测结肠癌预后风险的系统,其特征在于,所述预测结肠癌预后风险的系统包括数据输入模块、模型计算模块和结果输出模块;所述数据输入模块用于将结肠癌病人的自噬相关基因表达值的结果输入模型计算模块,所述自噬相关基因包括所述自噬相关mRNA 或/和lncRNAs;所述模型计算模块根据所述自噬相关基因表达值和如权利要求3 所述的结肠癌风险预测模型中的自噬相关mRNA 风险模型公式、自噬相关lncRNA 风险模型公式和/或结合所述自噬相关mRNA 和自噬相关lncRNA 的风险预测模型公式进行计算;所述结果输出模块用于根据结肠癌病人自噬相关mRNA 和/或lncRNA 的风险值来预测结肠癌病人的预后风险。

5.根据权利要求4 所述的预测结肠癌预后风险的系统,其特征在于,按照所述自噬相关mRNA 风险模型公式计算得到的结果≥0.954 时,判定结肠癌预后为高风险;按照所述自噬相关mRNA 风险模型公式计算得到的结果<0.954 时,判定结肠癌预后为低风险。

6.根据权利要求4 所述的预测结肠癌预后风险的系统,其特征在于,按照所述自噬相关lncRNAs 风险模型公式计算得到的结果≥1.009 时,判定结肠癌预后为高风险;按照所述自噬相关lncRNAs 风险模型公式计算得到的结果<1.009 时,判定结肠癌预后为低风险。

7.根据权利要求4 所述的预测结肠癌预后风险的系统,其特征在于,按照所述结合所述自噬相关mRNA 和自噬相关lncRNA 的风险预测模型公式计算得到的结果≥1.04 时,判定结肠癌预后为高风险;按照所述自噬相关mRNA 风险模型公式计算得到的结果<1.04 时,判定结肠癌预后为低风险。

8.一种结肠癌生存率预测模型,其特征在于,所述结肠癌生产率预测模型通过以根据权利要求3 所述的预测结肠癌预后风险的模型计算得到的风险值、年龄和肿瘤分期为影响因素构建诺莫图得到,所述诺莫图如附图5、附图6、附图7 所示。

9.一种结肠癌生存率预测系统,其特征在于,所述结肠癌生存率预测系统根据如权利要求8 所述的结肠癌生存率预测模型构建得到,所述结肠癌生存率预测系统的形式包括但不限于绘制有所述诺莫图的可见载体、网页计算器或小程序中的任意一种或几种的组合。

10.用于检测如权利要求1 所述的标志物的RT–qPCR 引物组,其特征在于,包括下述引物:检测GRID1 的上游引物如SEQ ID NO.1 所示,检测GRID1 的下游引物如SEQ ID NO.2 所示;检测DAPK1 的上游引物如SEQ ID NO.3 所示,检测DAPK1 的下游引物如SEQ ID NO.4 所示;检测RAB7A 的上游引物如SEQ ID NO.5 所示,检测RAB7A 的下游引物如SEQ ID NO.6 所示;检测PELP1 的上游引物如SEQ ID NO.7 所示,检测PELP1 的下游引物如SEQ ID NO.8 所示;检测ULK3 的上游引物如SEQ ID NO.9 所示,检测ULK3 的下游引物如SEQ ID NO.10 所示;检测WIPI2 的上游引物如SEQ ID NO.11 所示,检测WIPI2 的下游引物如SEQ ID NO.12 所示;检测AL354993.2 的上游引物如SEQ ID NO.13 所示,检测AL354993.2 的下游引物如SEQ ID NO.14 所示;检测AC048344.4 的上游引物如SEQ ID NO.15 所示,检测AC048344.4 的下游引物如SEQ ID NO.16 所示;检测CASC9 的上游引物如SEQ ID NO.17 所示,检测CASC9 的下游引物如SEQ ID NO.18 所示;检测AP006621.2 的上游引物如SEQ ID NO.19 所示,检测AP006621.2 的下游引物如SEQ ID NO.20 所示;检测AC010973.2 的上游引物如SEQ ID NO.21 所示,检测AC010973.2 的下游引物如SEQ ID NO.22 所示;检测GS1‑124K5.4 的上游引物如SEQ ID NO.23 所示,检测GRID1 的下游引物如SEQ ID NO.24 所示;检测MIR4435‑2HG 的上游引物如SEQ ID NO.25 所示,检测MIR4435‑2HG 的下游引物如SEQ ID NO.26 所示;检测PCAT6 的上游引物如SEQ ID NO.27 所示,检测PCAT6 的下游引物如SEQ ID NO.28 所示;检测AL590483.1 的上游引物如SEQ ID NO.29 所示,检测AL590483.1 的下游引物如SEQ ID NO.30 所示;检测AL137782.1 的上游引物如SEQ ID NO.31 所示,检测AL137782.1 的下游引物如SEQ ID NO.32 所示; 检测STAG3L5P‑PVRIG2P‑PILRB 的上游引物如SEQ ID NO.33 所示, 检测STAG3L5P‑PVRIG2P‑PILRB 的下游引物如SEQ ID NO.34 所示; 检测LINC00513 的上游引物如SEQ ID NO.35 所示,检测LINC00513 的下游引物如SEQ ID NO.36 所示;检测SNHG16 的上游引物如SEQ ID NO.37 所示,检测SNHG16 的下游引物如SEQ ID NO.38 所示;检测AP001554.1 的上游引物如SEQ ID NO.39 所示,检测AP001554.1 的下游引物如SEQ ID NO.40 所示;检测GAPDH 的上游引物如SEQ ID NO.41 所示,检测GAPDH 的下游引物如SEQ ID NO.42 所示;检测GDC 的上游引物如SEQ ID NO.43 所示,检测GDC 的下游引物如SEQ ID NO.44 所示;检测RTC 的上游引物如SEQ ID NO.45 所示,检测RTC 的下游引物如SEQ ID NO.46 所示。

11.一种试剂盒,所述试剂盒包括用于检测如权利要求1 所述的标志物的试剂、如权利要求3 所述的预测结肠癌预后风险的模型、如权利要求4 所述的预测结肠癌预后风险的系统、如权利要求5‑7 任一所述的结肠癌生存率预测模型、如权利要求9 所述的结肠癌生存率预测系统和如权利要求10 所述的引物组中的任意一种或几种的组合。

12.一种检测结肠癌自噬相关基因的PCR 芯片,其特征在于,包含如权利要求10所述的引物组。