1.一种预测结肠癌预后的标志物,其特征在于,所述标志物包括自噬相关的lncRNA和/或自噬相关的mRNA标志物,所述自噬相关的lncRNA为CASC9、PCAT6、AP006621.2、GS1-
124K5.4、MIR4435-2HG、AL354993.2、AC048344.4、AC010973.2、AL590483.1、AL137782.1、STAG3L5P-PVRIG2P-PILRB、LINC00513、SNHG16和AP001554.1,所述自噬相关的mRNA为GRID1、DAPK1、RAB7A、PELP1、ULK3和WIPI2。
2.根据权利要求1所述的预测结肠癌预后的标志物在结肠癌预后中的应用;所述应用包括但不限于构建预测结肠癌预后风险的模型、构建预测结肠癌生存率的模型、制备用于预测结肠癌预后风险的检测试剂或装置、制备用于预测结肠癌生存率的检测试剂或装置中的任意一种或几种的组合。
3.一种预测结肠癌预后风险的模型,其特征在于,所述模型包括自噬相关mRNA风险预测模型、自噬相关lncRNA风险预测模型和/或结合所述自噬相关mRNA和自噬相关lncRNA的风险预测模型;所述自噬相关mRNA风险预测模型公式=(0.524×expression level of UKL3)+(1.022×expression level of GRID1)+(0.254×expression level of DAPK1)+(0.410×expression level of PELP1)+(0.608×expression level of WIP2)+(1.097×expression level of RAB7A);所述自噬相关lncRNA风险预测模型公式=(0.183×expression level of CASC9)+(0.334×expression level of PCAT6)+(0.348×expression level of AP006621.2)+(0.409×expression level of GS1-124K5.4)+(0.651×expression level of MIR4435-2HG)+(0.838×expression level of AL354993.2)+(0.881×expression level of AC048344.4)+(1.145×expression level of AC010973.2)+(-0.882×expression level of AL590483.1)+(-0.875×expression level of AL137782.1)+(-0.688×expression level of STAG3L5P-PVRIG2P-PILRB)+(-
0.665×expression level of LINC00513)+(-0.663×expression level of SNHG16)+(-
0.573×expression level of AP001554.1);结合所述自噬相关mRNA和自噬相关lncRNA的风险预测模型公式=(-0.361×expression level of AP001554.1)+(0.150×expression level of AP006621.2)+(0.023×expression level of ULK3)+(0.564×expression level of AL354993.2)+(0.379×expression level of MIR4435-2HG)+(×-
0.025expression level of GRID1)+(0.130×expression level of PCAT6)+(-0.591×expression level of STAG3L5P-PVRIG2P-PILRB)+(0.021×expression level of CASC9)+(-0.169×expression level of LINC00513)+(0.015×expression level of DAPK1)+(-0.125×expression level of SNHG16)+(0.769×expression level of AC048344.4)+(0.029×expression level of GS1-124K5.4)+(-0.005×expression level of PELP1)+(0.023×expression level of WIPI2)+(-1.118×expression level of AL1 37782.1)+(0.814×expression level of AC010973.2)+(0.01×expression level of RAB7A)+(-0.641×expression level of AL590483.1)。
4.一种预测结肠癌预后风险的系统,其特征在于,所述预测结肠癌预后风险的系统包括数据输入模块、模型计算模块和结果输出模块;
所述数据输入模块用于将结肠癌病人的自噬相关基因表达值的结果输入模型计算模块,所述自噬相关基因包括所述自噬相关mRNA或/和lncRNAs;
所述模型计算模块根据所述自噬相关基因表达值和如权利要求3所述的结肠癌风险预测模型中的自噬相关mRNA风险模型公式、自噬相关lncRNA风险模型公式和/或结合所述自噬相关mRNA和自噬相关lncRNA的风险预测模型公式进行计算;
所述结果输出模块用于根据结肠癌病人自噬相关mRNA和/或lncRNA的风险值来预测结肠癌病人的预后风险。
5.根据权利要求4所述的预测结肠癌预后风险的系统,其特征在于,按照所述自噬相关mRNA风险模型公式计算得到的结果≥0.954时,判定结肠癌预后为高风险;按照所述自噬相关mRNA风险模型公式计算得到的结果<0.954时,判定结肠癌预后为低风险;优选的,按照所述自噬相关lncRNAs风险模型公式计算得到的结果≥1.009时,判定结肠癌预后为高风险;
优选的,按照所述自噬相关lncRNAs风险模型公式计算得到的结果<1.009时,判定结肠癌预后为低风险;按照所述结合所述自噬相关mRNA和自噬相关lncRNA的风险预测模型公式计算得到的结果≥1.04时,判定结肠癌预后为高风险;按照所述自噬相关mRNA风险模型公式计算得到的结果<1.04时,判定结肠癌预后为低风险。
6.一种结肠癌生存率预测模型,其特征在于,所述结肠癌生产率预测模型通过以根据权利要求3所述的预测结肠癌预后风险的模型计算得到的风险值、年龄和肿瘤分期为影响因素构建诺莫图得到。
7.一种结肠癌生存率预测系统,其特征在于,所述结肠癌生存率预测系统根据如权利要求6所述的结肠癌生存率预测模型构建得到,所述结肠癌生存率预测系统的形式包括但不限于绘制有所述诺莫图的可见载体、网页计算器或小程序中的任意一种或几种的组合。
8.用于检测如权利要求1所述的标志物的RT–qPCR引物组,其特征在于,包括下述引物中的至少一种:检测GRID1的上游引物如SEQ ID NO.1所示,检测GRID1的下游引物如SEQ ID NO.2所示;检测DAPK1的上游引物如SEQ ID NO.3所示,检测DAPK1的下游引物如SEQ ID NO.4所示;检测RAB7A的上游引物如SEQ ID NO.5所示,检测RAB7A的下游引物如SEQ ID NO.6所示;检测PELP1的上游引物如SEQ ID NO.7所示,检测PELP1的下游引物如SEQ ID NO.8所示;检测ULK3的上游引物如SEQ ID NO.9所示,检测ULK3的下游引物如SEQ ID NO.10所示;检测WIPI2的上游引物如SEQ ID NO.11所示,检测WIPI2的下游引物如SEQ ID NO.12所示;检测AL354993.2的上游引物如SEQ ID NO.13所示,检测AL354993.2的下游引物如SEQ ID NO.14所示;检测AC048344.4的上游引物如SEQ ID NO.15所示,检测AC048344.4的下游引物如SEQ ID NO.16所示;检测CASC9的上游引物如SEQ ID NO.17所示,检测CASC9的下游引物如SEQ ID NO.18所示;检测AP006621.2的上游引物如SEQ ID NO.19所示,检测AP006621.2的下游引物如SEQ ID NO.20所示;检测AC010973.2的上游引物如SEQ ID NO.21所示,检测AC010973.2的下游引物如SEQ ID NO.22所示;检测GS1-124K5.4的上游引物如SEQ ID NO.23所示,检测GRID1的下游引物如SEQ ID NO.24所示;检测MIR4435-2HG的上游引物如SEQ ID NO.25所示,检测MIR4435-2HG的下游引物如SEQ ID NO.26所示;检测PCAT6的上游引物如SEQ ID NO.27所示,检测PCAT6的下游引物如SEQ ID NO.28所示。检测AL590483.1的上游引物如SEQ ID NO.29所示,检测AL590483.1的下游引物如SEQ ID NO.30所示;检测AL137782.1的上游引物如SEQ ID NO.31所示,检测AL137782.1的下游引物如SEQ ID NO.32所示;检测STAG3L5P-PVRIG2P-PILRB的上游引物如SEQ ID NO.33所示,检测STAG3L5P-PVRIG2P-PILRB的下游引物如SEQ ID NO.34所示;检测LINC00513的上游引物如SEQ ID NO.35所示,检测LINC00513的下游引物如SEQ ID NO.36所示;检测SNHG16的上游引物如SEQ ID NO.37所示,检测SNHG16的下游引物如SEQ ID NO.38所示;检测AP001554.1的上游引物如SEQ ID NO.39所示,检测AP001554.1的下游引物如SEQ ID NO.40所示;检测GAPDH的上游引物如SEQ ID NO.41所示,检测GAPDH的下游引物如SEQ ID NO.42所示;检测GDC的上游引物如SEQ ID NO.43所示,检测GDC的下游引物如SEQ ID NO.44所示;检测RTC的上游引物如SEQ ID NO.45所示,检测RTC的下游引物如SEQ ID NO.46所示。
9.一种试剂盒,所述试剂盒包括用于检测如权利要求1所述的标志物的试剂、如权利要求3所述的预测结肠癌预后风险的模型、如权利要求4所述的预测结肠癌预后风险的系统、如权利要求5所述的结肠癌生存率预测模型、如权利要求6所述的结肠癌生存率预测系统和如权利要求8所述的引物组中的任意一种或几种的组合。
10.一种检测结肠癌自噬相关基因的PCR芯片,其特征在于,包含如权利要求8所述的引物组。