1.一种水稻稻瘟病菌无毒基因AvrPit，其特征在于，其DNA序列如SEQ ID NO.1所示。

2.一种水稻稻瘟病菌无毒基因AvrPit，其特征在于，其cDNA序列如SEQ ID NO.2所示。

3.由权利要求1或权利要求2所述基因AvrPit编码的蛋白质，其特征在于，其氨基酸序列如SEQ ID NO.3所示，或该序列替换、缺失、或添加一个或几个氨基酸残基而形成的具有相同功能的氨基酸多肽。

4.一种重组突变体，其特征在于，其核苷酸序列如SEQ ID NO.10所示。

5.含有权利要求1所述无毒基因AvrPit的载体。

6.含有权利要求5所述载体的重组体菌株。

7.权利要求1所述无毒基因AvrPit在设计特异性分子标记中的应用。

8.一种稻瘟病菌无毒基因AvrPit的特异性分子标记，其特征在于：该特异性分子标记包括但不限于由如下3个标记的任一或任几个组成；所述3个标记分别通过SEQ ID NO.4和SEQ ID NO.5所示的引物对AvrPit-CDS-F/R、SEQ ID NO.6和SEQ ID NO.7所示的引物对AvrPit-A-F/R、SEQ ID NO.8和SEQ ID NO.9所示的引物对AvrPit-V-F/R扩增得到。

9.权利要求1所述无毒基因AvrPit、权利要求5所述载体、权利要求6所述重组体菌株、权利要求8所述的特异性分子标记的应用，其特征在于，是在监测稻作区稻瘟病菌群体的生理小种组成及其群体遗传结构的动态变化情况，进行抗病品种合理的布局及轮换方面的应用。