1.一种基于单倍体诱导系的水稻双单倍体育种方法，其特征在于，包含如下步骤：

S1.选择优良的水稻三系保持系材料，与具有显性红米基因的水稻材料杂交，并利用保持系回交多个世代，选育出携带显性红米基因的红米保持系；

S2.将筛选出的携带显性红米基因的红米保持系材料在浓度为0.3％-1.0％的EMS中浸泡12h-24h，获得含有水稻着丝粒基因功能突变体的红米保持系材料；

S3.定向筛选水稻着丝粒基因功能突变体，筛选出的突变体自交2个世代形成稳定遗传材料；

S4.将步骤S3中筛选出的稳定的遗传材料与与水稻三系不育系杂交，以红米保持系突变体为轮回亲本回交5个世代，完成不育系核基因的替换，获得携带红米基因和着丝粒突变基因的红米单倍体诱导保持系和不育系；

S5.根据育种目标配制的杂交F1与红米单倍体诱导不育系杂交，对获得的杂交种子进行种皮颜色鉴定，淘汰红色种皮杂交种子，保留无色种皮杂交种子；

S6.利用秋水仙素对无色种皮杂交种子进行处理，获得加倍后的二倍体材料，鉴定二倍体材料农艺性状或基因型，形成新品系。

2.根据权利要求1所述基于单倍体诱导系的水稻单倍体育种方法，其特征在于，S3中定向筛选方法为利用测序检测CENH3基因的GGA→GAG序列差异，与对照有差异的材料为突变体。

3.根据权利要求1所述基于单倍体诱导系的水稻双单倍体育种方法，其特征在于，S4中所述将红米保持系突变体与水稻三系不育系杂交，以红米保持系突变体为轮回亲本回交5个世代，完成不育系核基因的替换，每个回交世代中选择红色种皮种子进行下一轮回交，红色种皮种子为二倍体，携带杂合的红色种皮基因。

4.根据权利要求1所述基于单倍体诱导系的水稻双单倍体育种方法，其特征在于，S5中所述对获得的杂交种子进行种皮颜色鉴定，其中种皮呈现红色的种子为非单倍体种子，种皮无色的种子为单倍体种子，可利用人工或机器实现种皮颜色的筛选。

5.根据权利要求1所述基于单倍体诱导系的水稻双单倍体育种方法，其特征在于，S6中所述无色种皮杂交种子用秋水仙素进行处理，指利用浓度为0.6％的秋水仙素浸泡胚萌动的种子8h，浸泡结束后即可实现单倍体的加倍。