1.一种基于INDEL-SNP连锁关系分析混合样本DNA的方法,其特征在于:所述方法包括下述步骤:
(1)、对混合样本DNA进行RT-PCR扩增,得到包含INDEL和SNP两个位点的RT-PCR扩增产物;
(2)、对步骤(1)中得到的扩增产物中所含有的SNP进行分型。
2.根据权利要求1所述的一种基于INDEL-SNP连锁关系分析混合样本DNA的方法,其特征在于,步骤(1)的具体步骤为:对提取的DNA样本分别用22对引物进行RT-PCR,其中反应体系为10ul体系:SYBR 5ul、PRIMER 1ul、DNA 100ng,补水至10ul;
RT-PCR的扩增条件:95℃30s;95℃5s,58℃30s,共40个循环;为了建立PCR产物的溶解曲线,扩增反应结束后,继续从60℃按每5s升高1℃缓慢加热到95℃;
所述22对引物为:P1:SEQ No.1、SEQ No.2;P2:SEQ No.3、SEQ No.2;P3:SEQ No.4、SEQ No.5;P4:SEQ No.6、SEQ No.5;P5:SEQ No.7、SEQ No.8;P6:SEQ No.9、SEQ No.8;P7:SEQ No.10、SEQ No.11;P8:SEQ No.12、SEQ No.11;P9:SEQ No.13、SEQ No.14;P10:SEQ No.15、SEQ No.14;P11:SEQ No.16、SEQ No.17;P12:SEQ No.18、SEQ No.17;P13:SEQ No.19、SEQ No.20;P14:SEQ No.21、SEQ No.20;P15:SEQ No.22、SEQ No.23;P16:SEQ No.24、SEQ No.23;P17:SEQ No.25、SEQ No.26;P18:SEQ No.27、SEQ No.26;P19:SEQ No.28、SEQ No.29;P20:SEQ No.30、SEQ No.29;P21:SEQ No.31、SEQ No.32;P22:SEQ No.33、SEQ No.32。
3.根据权利要求1所述的一种基于INDEL-SNP连锁关系分析混合样本DNA的方法,其特征在于,步骤(2)中对步骤(1)中得到的扩增产物中所含有的SNP进行分型的方法为直接测序法、连接酶法、SSCP法、单碱基延伸微测序法、质谱法或液相色谱分析法中的一种。