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专利号: 2013106427519
申请人: 浙江农林大学
专利类型:发明专利
专利状态:已下证
专利领域: 生物化学;啤酒;烈性酒;果汁酒;醋;微生物学;酶学;突变或遗传工程
更新日期:2024-01-05
缴费截止日期: 暂无
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摘要:

权利要求书:

1.一种克隆梅花中LFY同源基因编码区全序列的方法,其特征在于,包括以下步骤:A、基因组水平克隆

A1、提取梅花叶片中的DNA;

A2、引物的设计及PCR反应:设计一对简并引物,上游引物在起始密码子的上游区域设计,下游引物在终止密码子的下游区域设计;设计的引物为:上游引物P1:5′-GGAAAATATGGATCCRGA-3′下游引物P2:5′-TCARTAGGGYAGGTGMTC-3′用DNA为模板进行PCR操作扩增LFY同源基因,PCR反应体系为20ul体系:2μL10×EX -1Taq buffer,1.6μL dNTP(10mmol·L ),0.2μL的Ex Tap酶,上下游引物各0.4μL,1μL的DNA,14.4μL的ddH2O,反应条件为95℃预变性5min,30个循环:94℃,50s;58℃,50s;

72℃,1min30s,最后72℃,10min;

A3、PCR产物的回收和纯化;

A4、克隆;

B、基因编码区全序列克隆

B1、提取梅花叶片中的总RNA,然后将总RNA反转录成cDNA;

B2、引物的设计及PCR反应:在基因组测序结果的基础上设计一对特异性引物,上下游引物分别包括起始密码子和终止密码子;设计的引物为:上游引物Q1:5′-ATGGATCCAGACGCCTTCTC-3′下游引物Q2:5′-TCAGTAGGGTAGGTGATCACTGC-3′用cDNA为模板进行PCR操作扩增LFY同源基因,PCR反应体系为20ul体系:2μL10×EX -1Taq buffer,1.6μL dNTP:10mmol·L ,0.2μL的Ex Tap酶,上下游引物各0.4μL,1μL的DNA,14.4μL的ddH2O.),反应条件为95℃预变性5min,30个循环:94℃,50s;58℃,50s;

72℃,1min30s,最后72℃10min;

B3、PCR产物的回收和纯化;

B4、克隆。

2.根据权利要求1所述的克隆梅花中LFY同源基因编码区全序列的方法,其特征在于,步骤A1中DNA的提取步骤为:

1)快速称取0.2g果梅幼叶于预冷灭过菌的研钵中,并加入少量PVP和2%β-巯基乙醇,加液氮研磨成粉状后立即加入600ul STE核分离缓冲液,迅速研磨成糊状匀浆,小心转入1.5mL离心管中,上下颠倒混匀,放置0℃冰浴10min;

2)取出,4℃下5000rpm离心10min,弃上清液,若上清液仍粘稠,用STE核分离液反复清洗后离心;

3)往沉淀中加入600ul65℃预热的3×CTAB核裂解液和10ulβ-巯基乙醇,同时洗净管盖及管壁上残留的植物组织,将材料轻轻混匀,65℃水浴保温60min,期间不时轻轻摇动离心管几次;

4)取出,冷却几分钟后加入600ul氯仿/异戊醇体积比24:1和“PCN”溶液0.0675g PVP,45ul10%CTAB+4%NaCl,摇匀,室温静置5min后10000rpm离心10min;

5)转上清液于一新的离心管,重复抽提2~3次,每次抽提时都加入“PCN”溶液去多糖;

-1

6)取上清液,加入RNaseA至终浓度为10μg·mL ,37℃水浴保温30min,取出后加入-1

1/5体积5mol·L NaCl和2倍体积预冷的乙醇,颠倒摇匀,-20℃静置30min沉淀DNA;

7)挑出DNA集结成白色絮状用70%的乙醇清洗2次,室温风干后溶于50ulTE中,-20℃贮存备用。

3.根据权利要求1所述的克隆梅花中LFY同源基因编码区全序列的方法,其特征在于,步骤B1中所述RNA提取步骤为:

1)在10ml离心管中加入5ml CTAB和0.2ml的β-巯基乙醇,放入65℃水浴锅中预热;

2)在液氮预冷好的研钵中将样品磨细,磨样时加入适量的PVP,分装于预热好的离心管中,每管3药匙,涡旋仪上涡旋混匀1min,然后将离心管放入65℃水浴锅中加热,期间每个隔10min不时上下颠倒混匀,水浴持续30min;

3)再在混合物中加入3ml的酸性饱和酚:氯仿:异戊醇25:24:1,混合均匀后

12000rpm,离心10min,常温;

4)吸取离心后的上清液3.5ml转入新的10ml离心管中,然后再加入3.5ml的氯仿:异戊醇24:1,上下颠倒混匀后12000rpm,4℃,离心10min;

5)重复第4)步,直至中间层消失;

6)第5)步完成后将上清分装入1.5ml离心管中,每管约0.7ml,然后加入等体积的预冷的异丙醇,上下颠倒混匀后放入-20℃冰箱中冷冻30min;

7)将冷冻的离心管按4℃,14000rpm,离心10min要求进行离心,离心完成后将上面液体倒掉,保留离心管底部白色透明状的沉淀;

8)再加入适量的65℃预热好的SSTE溶解沉淀;

9)在溶解好沉淀的溶液里加入1ml的Trizol试剂,再加入0.25ml的氯仿,混匀后放置

5-10min,12000rpm,4℃,离心10min;

10)转移上清液于新的离心管中,加入等体积遇冷的异丙醇,混匀后放置于冰上静置

15min;

11)完成后4℃,12000rpm,离心15min收集沉淀;

12)收集到的沉淀中加入DEPC水处理的75%乙醇1ml,4℃,12000rpm,离心10min,倒去上清液,重复一次;

13)将液体倒掉,通风条件下晾干管中液体,加入30μlDEPC水溶解沉淀。