欢迎来到知嘟嘟! 联系电话:13336804447 卖家免费入驻,海量在线求购! 卖家免费入驻,海量在线求购!
知嘟嘟
我要发布
联系电话:13336804447
知嘟嘟经纪人
收藏
专利号: 2022103626416
申请人: 苏州科技大学
专利类型:发明专利
专利状态:已下证
更新日期:2026-04-02
缴费截止日期: 暂无
价格&联系人
年费信息
委托购买

摘要:

权利要求书:

1.一种基于深度稀疏表示网络的DNA结合蛋白识别方法,其特征在于:包括以下具体步骤:S1,获取DNA结合蛋白序列数据集,所述DNA结合蛋白序列数据集分为训练集和测试集;S2,采用PSL-BLAST软件计算所述DNA结合蛋白序列数据集内所有序列的特异性打分矩阵;S3,将所有的所述特异性打分矩阵分别填充或裁剪成相同尺寸的新特异性打分矩阵;S4,采用深度稀疏表示网络构建并训练DNA结合蛋白识别分类器模型;S5,将步骤S3中的所述新特异性打分矩阵输入所述DNA结合蛋白识别分类器模型内,完成对所述DNA结合蛋白序列的识别,具体包括:S41,将步骤S1中的所述训练集和所述测试集进行行拼接得到拼接数据集

2.根据权利要求1所述的基于深度稀疏表示网络的DNA结合蛋白识别方法,其特征在于:步骤S2中,采用PSI-BLAST软件生成特异性打分矩阵矩阵,生成的命令为BLAST+options:-num_iter ations 3-db n r-inclusion_eth resh0.001。

3.根据权利要求1所述的基于深度稀疏表示网络的DNA结合蛋白识别方法,其特征在于:步骤S2中,所述特异性打分矩阵矩阵为PSSM,具体公式为

4.根据权利要求3所述的基于深度稀疏表示网络的DNA结合蛋白识别方法,其特征在于:所述步骤S3具体为:当所述序列的PSSM行数大于70时,对底部多出来的行裁剪掉;当所述序列的PSSM行数小于70时,对底部缺少的的行用0补充。