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专利号: 2019106123328
申请人: 厦门极元科技有限公司
专利类型:发明专利
专利状态:授权未缴费
专利领域: 基本电子电路
更新日期:2025-07-23
缴费截止日期: 暂无
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摘要:

权利要求书:

1.一种数据压缩方法,包括:

获取测序数据中的质量值序列;

获取所述质量值序列中的任一质量值的优先级分数,所述优先级分数表征所述任一质量值对于与所述测序数据相关的基因型的影响程度;

基于所述优先级分数对所述任一质量值的比特平面进行位移,得到更新的质量值序列;以及基于比特平面编码算法对所述更新的质量值序列进行编码,得到所述质量值序列的压缩比特流,其中,所述获取所述质量值序列中的任一质量值的优先级分数包括:为所述任一质量值设置第一偏差量和第二偏差量;

在所述任一质量值增加所述第一偏差量的情况下,计算与所述测序数据相关的基因型的第一概率;

在所述任一质量值减少所述第二偏差量的情况下,计算与所述测序数据相关的基因型的第二概率;以及基于所述第一偏差量、所述第二偏差量、所述第一概率和所述第二概率,得到所述任一质量值的优先级分数。

2.根据权利要求1所述的方法,其中,所述计算与所述测序数据相关的基因型的第一概率和所述计算与所述测序数据相关的基因型的第二概率包括:基于贝叶斯算法计算与所述测序数据相关的基因型的后验概率。

3.根据权利要求1所述的方法,其中,所述得到所述任一质量值的优先级分数包括:计算所述第一概率和所述第二概率之间的第三偏差量;

将所述第一偏差量和所述第二偏差量之和作为第四偏差量;以及基于所述第三偏差量和所述第四偏差量的比值,得到所述任一质量值的优先级分数。

4.根据权利要求1所述的方法,其中,所述计算与所述测序数据相关的基因型的第一概率和所述计算与所述测序数据相关的基因型的第二概率包括:当与所述测序数据相关的基因型包括多个基因型时,分别计算所述多个基因型中的任一基因型的第一概率和第二概率;

所述得到所述任一质量值的优先级分数包括:

计算所述任一基因型的第一概率和第二概率之间的第三偏差量;

将所述第一偏差量和所述第二偏差量之和作为第四偏差量;以及基于与所述多个基因型中的各基因型对应的第三偏差量的均值与所述第四偏差量的比值得到所述任一质量值的优先级分数,或者,当与所述任一基因型对应的第三偏差量大于与所述多个基因型中的其他基因型对应的第三偏差量时,基于与所述任一基因型对应的第三偏差量与所述第四偏差量的比值得到所述任一质量值的优先级分数。

5.根据权利要求1所述的方法,其中,所述基于所述优先级分数对所述任一质量值的比特平面进行位移包括:当所述优先级分数小于等于零时,确定位移量为0;

当所述优先级分数大于零小于第一数值时,确定所述位移量为所述优先级分数的取整结果;

当所述优先级分数大于等于所述第一数值时,确定所述位移量为所述第一数值;以及将所述任一质量值的比特平面移动所述位移量,得到所述更新的质量值序列。